Управление лицеем осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации с учетом особенностей, установленных Федеральным законом от 29.12.2012 N 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» (ст. 26), Уставом лицея на принципах демократичности, открытости, приоритета общечеловеческих ценностей, охраны жизни и здоровья человека, свободного развития личности, единоначалия и самоуправления.
Лицей самостоятелен в осуществлении образовательной, административной деятельности, разработке и принятии локальных нормативных актов в пределах, установленных действующим законодательством и Уставом лицея.
Непосредственное управление лицеем осуществляет директор, прошедший аттестацию, действующий в соответствии с законодательством Российской Федерации, Уставом лицея, трудовым договором и должностной инструкцией.